El objetivo de estas ayudas es revitalizar la actividad comercial de los municipios y, a su vez, poner en valor los entornos urbanos, mediante la creación de estructuras de colaboración público-privadas en el sector de la distribución comercial. El Gobierno vasco precisó que se trata de un programa de apoyo que, a través de acuerdos de colaboración entre los ayuntamientos y las Asociaciones de comerciantes y mediante subvenciones no reintegrables, impulsará el desarrollo de la actividad comercial de los municipios.
Desde este programa se promoverán tanto las actuaciones de carácter urbanístico, como las actividades de animación y dinamización del sector terciario de cara a potenciar la faceta comercial de los diferentes municipios. El programa "Merkagune-Comercio Urbano" cuenta con una dotación presupuestaria de 6.720.000 euros para el presente ejercicio.