La detención se ha producido sobre las doce del mediodía, cuando Gogeaskoetxe salía de su casa, según ha informado el movimiento de apoyo a los presos de ETA, Askatatuna. En el momento del arresto, las autoridades francesas han comunicado a la novia de Goieaskoetxea que la detención se produce por orden de la jueza antiterrorista Laurence Le Vert. Los agentes han registrado su coche y posteriormente se han llevado a Gogeaskoetxe a la comisaría de Baiona. La detención se enmarca en la operación conjunta llevada a cabo por la gendarmería y la Policía Nacional francesa el pasado 24 de septiembre en Baiona en donde fueron capturados y posteriormente puestos en libertad catorce de los dieciocho dirigentes de la rama francesa de Batasuna. En esa operación Gregorio Jiménez Morales y Zigor Gogeaskoetxe no pudieron ser localizados a pesar de que también estaban en la lista de los que iban a ser detenidos.